Los párrafos 7 y 8 del capítulo 26 de la Confesión de Fe de 1689 responden a dos preguntas: ¿Tiene la iglesia autoridad?, y ¿quién gobierna la iglesia? Este es un tema que ha sido descuidado y malinterpretado por muchos. Algunos pastores caen en el autoritarismo y quitan la autoridad de Cristo, mientras que los creyentes reaccionan a esto cayendo en el otro extremo de rechazar cualquier tipo de autoridad. Pero la Biblia nos enseña que la autoridad pertenece a todo el cuerpo de la iglesia local y puede manifestarla en la toma de decisiones importantes. Esto no quiere decir que la iglesia es una democracia, pues el pastorado es quien dirige esa autoridad y ejerce el gobierno dentro de la iglesia de acuerdo a las Escrituras.